单细胞转录组测序（single cell RNA-seq, scRNA-seq），是在单个细胞水平对 mRNA 进行高通量测序的一项新技术，其能够以高通量和单分子分辨率研究单个细胞表达谱，揭示复杂细胞群体的异质性，避免单个细胞的基因表达信号被群体的平均化所掩盖。 

       10x Genomics系统具有高通量、周期短、适用范围广等优势，一个样品可进行1000~10000个细胞转录组分析；6.5min可完成上万细胞的封装，一天内完成单细胞捕获、反转录扩增与建库；相较其他平台，单个细胞的测序成本低；适用于绝大部分的细胞类型，包括生殖细胞、胚胎细胞、血细胞、神经细胞、肿瘤细胞、免疫细胞、干细胞等。

技术原理 

10× Genomics的Chromium系统利用8通道的微流体“双十字”交叉系统将含barcode的凝胶珠（Gel Beads）、细胞和酶的混合物、油三者混合，形成GEMs（油包水的微体系）GEMs形成后，细胞裂解，凝胶珠自动溶解释放大量barcode序列随后mRNA逆转录产生带有10× barcode和UMI信息的cDNA，构建标准测序文库下图展示Chromium Single Cell 3’ Solution 中mRNA逆转录产生带有10× barcode和UMI信息的cDNA过程

应用领域
1. 发育生物学：胚胎、神经、脑等各种组织；
2. 细胞图谱绘制；

3. 干细胞分化潜能研究；
4. 免疫研究；
5. 肿瘤异质性与耐药性研究。